Полученный электролизом или термическими способами магний-сырец содержит ряд примесей, отрицательно влияющих на его коррозионную стойкость и механические свойства. Поэтому такой металл требует рафинирования. Вентиляция помещений, в которых будет проводиться рафинирование, должна быть организована очень тщательно, а для поддержания необходимой температуры необходимо использовать гибкие в настройке системы кондиционирования. Выпускаемый товарный магний по химическому составу должен отвечать требованиям металлургических стандартов.

Из нескольких известных способов рафинирования широкое применение в заводской практике получил способ плавки с флюсами. Флюсы состоят в основном из смеси хлористых и фтористых солей и имеют два назначения: во-первых, защищать расплавленный металл от контакта с воздухом путем создания на металле сплошного по»кровного слоя из флюсов; во-вторых, рафинировать магний благодаря способности агломерировать, осаждать и растворять некоторые (главным образом неметаллические) примеси, находящиеся во взвешенном состоянии. Однако рафинирование флюсами не освобождает магний от примесей железа, кремния и других металлов. Правда, некоторое снижение количества примесей железа достигается при отстаивании металла после рафинирования флюсами, в результате которого частицы железа осаждаются. Возможно также отстаиванием частично осадить кремний, если в расплаве он содержится в значительном количестве.

Более полное удаление железа достигается введением! в расплав добавки марганца, который поглощает железо и осаждает его при отстаивании расплава. Методика осаждения заключается в том, что в расплавленный магний, имеющий высокую температуру, вводится марганец в количестве, необходимом для получения насыщенного раствора. Затем расплав выдерживают при более низкой температуре, при которой вместе с избыточным марганцем выпадает железо. Этим способом примесь железа в металле снижается до тысячных долей процента.

Аналогичное действие на примеси железа оказывают добавки церия и циркония.